Iako je katolička verska zajednica postojala na teritoriji grada Niša još od srednjeg veka, osnivanje današnje crkve vezano je za XIX vek. Tokom izgradnje pruge Beograd - Niš, za potrebe radnika je u privatnoj kući kod gostionice Marger 1884. godine otvorena katolička kapela, stan i škola. Za vreme misije Ferdinanda Hrdija iz Češke, u Nišu je 1925. godine renovirana stara crkva posvećenu Presvetom Srcu Isusovu. Tom prilikom je crkva obnovljena i proširena, a 1934. godine po projektu Julijana Djupona dozidan joj je sprat.

Nova zgrada i župski stan, po planu arhitekte Zorana Markovića, izgrađeni su 1992. godine.

Vladimir Lukić

dipl. istoričar